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eTIcomplex

Synopsis

Les travaux du groupe EvoluTIF portent sur l'analyse comparative du polymorphisme des gènes codant pour les facteurs du complexe d'initiation de la traduction et notamment sur le facteur eIF4E. Ces gènes, fortement conservés au sein du règne végétal, en plus de leur fonction clé dans la traduction des ARNm de l'hôte, sont également impliqués dans la résistance aux virus à ARN chez plusieurs espèces [pour revue voir Robaglia & Caranta, 2006. Trends in Plant Science 11(1) :40-45].

eIF4E (eukaryotic translation Initiation Factor 4E), via une interaction directe avec la coiffe des ARN, est le premier facteur qui initie la traduction des ARNm dans les cellules eucaryotes. Ce facteur interagit également avec d'autres facteurs eIF pour permettre la circularisation de l'ARN et le recrutement de la sous-unité 40S du ribosome. Chez les plantes, eIF4E appartient à une petite famille multigénique. Par exemple, 5 gènes ont été identifiés chez Arabidopsis thaliana, dont 3 codent pour des protéines correspondant à l'isoforme eIF4E, un pour eIF(iso)4E et un pour la protéine nCBP (new Cap Binding Protein). Le rôle biologique de cette redondance génique reste encore à déterminer.

Le projet EvoluTIF (financé par le Bureau des Ressources Génétiques AO 2005-2006) vise à décrire et comparer le polymorphisme des gènes eIF4E chez cinq familles végétales incluant espèces modèles et espèces cultivées, afin de détecter des indices de sélection liés à l'interaction avec les virus et, le cas échéant, déterminer les caractéristiques (allogamie, cycle de vie) à l'origine de la variation observée.







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